藻类当中含有的营养元素能够被较小的虾苗摄食，其中含有的营养元素，如蛋白质、氨基酸等（详见下图）能够进一步促进小龙虾的生长。好的水肯定指的是含有藻类丰富的水源了，藻类较少的水，比如清水就难以养出大虾，“水清则无鱼”说的就是这个道理。清水，缺乏藻类的水体，非常容易造成青苔的滋生，像现在很多地区的池塘里开始出现青苔，给养殖户造成了比较大的困扰，在夏季缺乏有益藻类的池塘又会迎来夏季的第二个杀手——蓝藻！青苔和蓝藻都是小龙虾养殖过程中最大的敌害生物。
1：引进一部分有藻种的池塘水，然后再施肥，水体透明度较低，水体中的悬浮杂质容易将肥料中的有效成分吸附络合，阻碍了藻类的光合作用，从而引起肥水困难;
2：前期水温较低，限制了藻类的繁殖速度，造成肥水困难。待连续晴天、光照较强时再施肥，也可施豆浆、海藻粉等来增强藻类的光合作用，刺激藻类繁殖。
3：底泥板结，和水体间的物质交换停滞，造成肥水困难。施肥后第二天使用EM活菌制剂，或将有机肥料与EM活菌制剂混合浸泡1-2小时后施用。
4：温度过低的原因，不同的藻类对温度的需求也有所不同，过低的温度会造成新陈代谢缓慢，藻类长起不来。寒冷的冬季，水体结冰，雪花飘舞，也不会起作用。可以在水温达到 8℃以上时开始肥水，就会达到预期的效果。
5：青苔、丝藻等大型藻类或者杂藻过多 青苔、丝藻等过多的话不能肥水，因为大型藻类能够与小型藻类竞争营养物质，抑制单胞藻的繁殖和生长。此时肥水不但肥不起来还会使大型藻类大量繁殖，从而水更不好肥。
